Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptcd3Q14C51 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms