Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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