Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Traf3ip1Q149C2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Traf3ip1Q149C2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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