Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd12Q0VE29 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms