Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms