Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Plac8l1Q08EJ0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms