Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q08AU9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q08AU9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q08AU9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q08AU9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms