Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms