Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxc4Q08624 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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