Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms