Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn2Q08093 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms