Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms