Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms