Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms