Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms