Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms