Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelaQ04207 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms