Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms