Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms