Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms