Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms