Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms