Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms