Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms