Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gjb2Q00977 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms