Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms