Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms