Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms