Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms