Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfcP97953 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfcP97953 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfcP97953 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfcP97953 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfcP97953 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfcP97953 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VegfcP97953 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfcP97953 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfcP97953 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms