Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms