Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms