Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms