Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhodP97348 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhodP97348 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhodP97348 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhodP97348 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhodP97348 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhodP97348 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RhodP97348 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhodP97348 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms