Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mesp1P97309 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms