Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ElocP83940 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ElocP83940 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ElocP83940 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ElocP83940 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ElocP83940 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ElocP83940 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms