Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx1P83917 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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