Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms