Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf3P70671 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms