Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeboxP70368 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeboxP70368 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms