Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms