Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms