Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux2P70298 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms