Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms