Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms