Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms