Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SbdsP70122 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms