Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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