Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pcsk1P63239 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pcsk1P63239 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pcsk1P63239 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pcsk1P63239 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pcsk1P63239 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pcsk1P63239 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pcsk1P63239 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pcsk1P63239 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pcsk1P63239 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pcsk1P63239 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1P63239 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms