Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vsnl1P62761 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsnl1P62761 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms